1，整体与部分表达的范围和普遍程度不如普遍性和特殊性来得大。事物都可以从普遍与特殊两方面来分析，但不一定能用整体与部分来分析。比如人，是普遍的，而你是特殊的；而说人是整体，你是部分，这就不行。因为整体和部分是用来认识那些有机联系的事物的范畴，而普遍和特殊是适应一切事物的范畴。所以说普遍和特殊是对整体和部分的深化。2，不是包含同类个体，而是包含同类个体共有的属性。某个个体（比如你），你不仅有你自己个性，你还包含着“同类个体所共有的属性”（即人的属性。）每个人不仅是自己，还是人，而“人”是每个人共有的属性。不是你包含了别人（其他个体），而是你包含了与其他个人共有的属性（“人”这个属性）。3，系统论反映的是一种有机联系。所谓“有机”，指的是“不是简单相加”。比如，1+1=2，这是简单相加；而男人+女人=什么呢，不仅仅是等于两个人，还会产生其他东西，比如友情，爱情等。“有机”联系就是在组合起来以后产生了新的东西。所以系统反映是几个要素组成系统后，其结果不等于要素的相加，而是产生许多其他比要素简单相加还要多的效果。再举个例子，一个人干一个活要一天，两个人是不是就是半天呢，不一定，当他们有机组合起来，分工合作，也许1小时就能做完。这就是系统要反映的东西。