哲学的理念和哲学的智慧对于一项具体的研究工作来说，可能没有直接的价值，但是，人类科学发展历程的3次转折都是由于哲学的指引。第一次是在公元前5世纪的时候，古希腊的哲学家们第一次提出了一个理念，把自然界和神分离开来，把自然作为一个独立的客体，用理性的方法来研究它，才开始了真正的自然科学研究。第二次转折是近代科学的诞生，以伽利略为代表的科学家们使“实验是自然科学的基础”这一哲学论断，成为可以操作的科学方法，建立了近代科学工作者的传统。第三次转折是量子论和相对论的出现，哲学使人们抛弃了原有的习惯的观念和推理的方式。
当人类发明语言之后，就开始用概念思考，以自己的逻辑，更多的是使用联想来推理，哲学智慧在其中起着决定性的作用。在科学发展的关键点上，重要的往往不是具体方法的问题，而是这些具有哲学色彩的问题。