对于段玉裁的著作，留给后人更多的财富则是他的《说文解字注》，这本书花费了段玉裁的毕生心血，历经三十余年。这本书主要对《说文》本身的不足给予批评，对其内容进行了一些发凡起例，并且段玉裁在注译过程中注意到了同源词和同义词，当时清代的大批文人都对许慎的《说文解字》有过研究，而像段玉裁研究的这般透彻的，还无人能及，这也是他用了半生心血换来了，段玉裁有他自己的过人之处，更重要的其实还是他的执着。《说文解字注》对于当时学术界的影响可谓是非常巨大的，清朝的经济学家王念孙评价此书为“盖千七百年来无此作矣”。

段玉裁成就在清朝年间是有目共睹的，他的学术成果表现在哲学思想，经学研究，语言文学研究上。香港大学著名的教授黄耀鲲评价他为一个具有现代语言学视的清代学者。中国训诂学研究会长称赞段玉裁秉承了孔子开创的儒家学传统段玉裁成就在于哲学思想上他坚持师傅的观念，坚持“必于物上求理”，认为“阴阳气化即道”。他坚持于求真，他认为，追求真知的活动，是可使人的生命超越时间限制的。当然他也并没有完全重复老师的思想，而是发展了戴震的学说。在经学研究方面他没有写出一些可供依据参考的著作，只是通过对《春秋》《左传》等经典巨著中句子的辨析。主要研究了明世宗的继统问题，并且提出了自己的思想政治观点，而且也提出一些突破传统的主张。