北大校友朱建士（数力系58届）获得2002年第四届光华工程科技奖工程奖，校友范滇元（62届）、钟南山（医学部医疗系60届）获得2004年第五届光华工程科技奖工程奖。光华工程科技奖由中国工程院管理、承办，是中国工程科技界的最高奖。此前，北大校友张宗祜（地质系48届）、王寿云（数力系60届）、金国藩（工学院50届）曾荣膺此奖。

　　北大数学科学学院教授姜伯驹院士（数学力学系57届）获得2002年第五界华罗庚数学奖。北大校友姜礼尚教授（数学力学系57届）获2005廿第七届华罗庚数学奖。华罗庚数学奖是中国数学会与湖南教育出版社联合主办的为了纪念著名数学家华罗庚先生而设立的奖项，用以奖励并鼓励对中国数学事业的发展作出突出贡献的我国数学家。该奖自1992年以来的获奖数学家中，北大人有五位，位居各高校之冠。

　　北大校友、中科院数学与系统科学研究院巩馥洲研究员（1995年至1997年在数学科学学院从事博士后研究）和段海豹研究员（1987年博士毕业于北京大学）分获2003年第九届和2005年第十届 陈省身数学奖。该奖旨在奖励在数学领域作出突出成果的我国中青年数学家。自1986年以来，在获得该奖20位中青年数学家中，有北大校友8人，位居各高校之冠。

　　北大计算数学专业84届校友、香港浸会大学数学系讲座教授汤涛获2003年度冯康科学计算奖。1995年设立的冯康科学计算奖旨在奖励科学计算领域做出杰出贡献的海内外中国青年数学家。该奖每两年颁奖一次，奖金15，000元。自设立以来的11位获奖者中，有北大校友5位，居全国高校首位。

　　北大物理学院马伯强教授（物理系89届博士）获得2002－2003年度周培源物理奖。北大校友、中国科学院物理研究所解思深（物理系65届）、王恩哥（物理系90届博士）分别获得2000－2001、2004－2005年度周培源物理学奖。该奖项至今的六位获奖者中五位是北大毕业生。我校工学院黄永念教授（数力系63届、66届研究生）获得2002年第三届周培源力学奖，为该奖的第三位获奖者。周培源物理奖和力学奖由周培源基金会设立，每两年评选一次，一般每次评选一人或一个项目