（一）预算管理意识淡薄

　　目前，我国高等学校资金来源主要是国家财政拨款，学校无偿使用。因此，部分高校在资金的使用上缺乏成本管理意识，不注重提高资金的使用效益，节约使用经费的预算管理意识淡薄。缺乏在市场经济环境中自主办学的意识，不能多渠道筹措教育经费，不能统筹安排有限的资金，未建立科学有效的预算管理及监督机制，使高校预算管理不能发挥其应有的作用。
  

　　（二）预算编制方法不科学

　　大多数高校编制财务预算是依据增量预算法，即通常所说的“基数法”，或根据国家拨款来进行“估算”，这种方法不利于调整和优化支出结构，预算项目增加和调整的随意性比较大，不能维护预算的严肃性。预算编制的内容不全面，在预算支出方面没有包括基建资金支出，使高校的资金收支缺乏统一的筹划和控制。
  同时，预算编制程序缺乏科学性、客观性，对优化预算起不到应有的作用。

　　（三）预算编制不及时

　　高等学校的年度预算是按会计年度编制的，部分高校内部财务预算一般要到4月份才下达，致使学校的财务预算编制的时间滞后，使学校年初支出预算执行带有盲目性，不能发挥高校财务预算的监督作用。
  

　　（四）预算执行约束力不强

　　由于存在各种不确定因素，部分高校存在随意增加和调整预算项目，擅自扩大预算经费支出范围和提高开支标准，混淆开支渠道的现象。部分高校没有建立预算激励机制，节约的预算经费没有奖励，超支又要求追加，预算执行存在随意性，削弱了预算的权威性、严肃性，使高校财务预算丧失了约束力。
  

　　（五）预算绩效评价体系不完善

　　部分高校预算只注重资金的投入，而忽视了对资金支出的管理，对资金的使用结果、效益、效率也没有及时进行跟踪和调查，对资金投入的实际使用绩效缺乏有效的监督和考核。 　　

以上就是高校运算存在的问题。