这个问题很好理解，孔融是孔子的后裔，这是没有疑义的，但孔融不是孔子的直系继承人，仅仅是旁支。

灭了孔融三族，不影响孔子直系传承。因而自从有了“衍圣公”的封爵，历朝历代也就沿袭下来，直到民国终止。

01

孔子家族是遵循嫡长子世袭制

孔子十九岁的时候，娶了宋国人亓官氏为妻，一年后生了个儿子。鲁昭公派人送来了鲤鱼表示祝贺，孔子深感荣幸，就给儿子取名为鲤，字伯鱼。

孔鲤是孔子唯一的儿子，在孔子去世之前就死了，生有唯一的儿子孔伋。所有正统孔家后代都是孔伋的后裔。

孔子去世后，鲁哀公作诔文吊唁他，他的弟子们都来为他守墓。由于孔子的德行，受到了人们的祭祀，但这些都是来自于民间自发的奉祀活动。

汉高祖十二年（前195年），刘邦来到鲁地祭祀孔子，封孔腾为奉祀君，这是古代帝王册封孔子后裔的开始。

孔腾是孔子第九世孙，有资料介绍孔子九世孙还有孔鲋、孔树，孔腾是不是嫡长子没有记载。汉惠帝时，孔腾被征为博士，后迁长沙王太傅。

孔腾被确立为官方奉祀官之后，就延续嫡长子继承奉祀官的爵位。

02

孔子第十三世孙孔霸，汉元帝时封为“褒成侯”，赐食邑八百户。

孔霸就是孔融的七世祖，汉元帝的师傅，官至侍中。

根据孔子家谱，看一下之后几代孔氏家族的爵位继承人：

十四代   孔福，汉成帝绥和元年封为“殷绍嘉侯”。

十五代   孔房，褒成侯

十六代   孔均，褒成侯

十七代   孔志，褒成侯

十八代   孔损，褒亭侯

十九代   孔曜，奉圣亭侯。

二十代   孔完、孔赞，褒成侯。有资料说孔融是孔子十九世孙，有的说是二十世孙。

根据孔霸是孔子十三世孙，是孔融七世祖来看，孔融应该是二十世孙比较确切。

把孔子作为第一世，孔霸就是十三世，孔融就是二十世。

孔融与孔子第二十世爵位继承人孔完、孔赞（褒成侯）的亲疏关系已经比较疏远。

孔融的父亲空宙，祖父孔贤都不是十九世、十八世继承人，再往上就查不到孔融三世祖、四世祖、五世祖、六世祖的具体资料。这很可能是孔融与孔氏继承人关系已经很疏远。通俗的话说，就是孔融与同辈继承人已经是出了五服的兄弟，他们共同的七世祖是孔霸。

孔融被曹操夷灭了三族，按照汉朝的律法，三族指的是父族、母族、妻族。

因此，曹操不可能诛灭孔子继承人的家族，也就不会影响孔子宗族的世袭传承。

03

“衍圣公”的由来及终止

宋至和二年（1055年），宋仁宗改称孔子嫡长孙继承人为”衍圣公“。从此之后，“衍圣公”就成为孔子嫡长孙世袭封号，历经宋、金、元、明、清、民国，直到1935年国民政府改“衍圣公”孔德成为大成至圣先师奉祀官为止。

由此可知，“衍圣公”是三国之后几百年才有的封号。因为孔融并不是孔子嫡长孙继承人，曹操虽然夷灭孔融三族，但并没有影响孔子家族嫡长孙世袭传承。

这也就是孔融被夷灭三族，但历朝历代依然存在“衍圣公”的原因。