其实这各问题应该是要问的是，关于清朝中枢机构形成的历史，内阁、南书房、军机处都是清朝时期设立辅佐皇帝的中枢机构，而上书房则是清朝皇子读书的地方。我是善发，爱发历史说，欢迎关注我的头条号@善发历史说，感谢邀请回答。

内阁清代内阁主要沿袭明朝制度，内阁就是内廷殿阁的意思，清朝入关之后将原来的清朝内阁的前身内三院改为内阁，设立三殿（保和殿、文化殿、武英殿）大学士和三阁（体仁阁、文渊阁、东阁）大学士。

清代的内阁和明代的内阁大有不同，清代的内阁日常工作主要还是以辅助皇帝处理奏章、提供建议、编写书籍等，实际上是皇帝的高级秘书班子，辅佐皇帝处理国家政务，加上清代皇帝“乾纲独断”大权独揽，清朝的内阁和明朝的内阁早已经不能同日而语。

所以清朝的内阁大学士逐渐沦为位尊权轻的一个高级殊荣，不过始终是清朝文官体系当中最高级的一个名头。

内阁主要官员为三殿三阁大学士，满汉各配置两人，属于正一品的的品阶，大学士前面的名头无论是三殿还是三阁，其实都是一个荣誉虚衔没有太大意义。其下属还有协办大学士，从一品；内阁学士，从二品；侍读学士，从四品；侍读，正六品；典籍，正七品；内阁中书（又称中书舍人），从七品。

内阁下属还设有典籍南、北厅、满本房、汉本房、蒙古房等下属机构，就不一一赘述。

南书房清代康熙皇帝的时候，为了加强皇权，在乾清宫西南设立了南书房，然后召集了进士或者翰林出身的中央官员，除了陪皇帝学习读书之位，还负责为皇帝发布谕旨和政令，承办皇帝交待的例行事务，成为皇帝的贴身御用秘书班子，内阁的权利被分出了一部分。

南书房的官员称为“南书房行走”，人数不定，实际上属于一个临时秘书班子。

军机处雍正七年（公元1729年）清政府用兵青海，雍正皇帝为了迅速处理西北用兵的军机事务，于是在隆宗门内设立军机房，后又改为“办理军机事务处”简称军机处，是负责专办西北军务的临时事务部门。

随着战事日繁，加上国家政务渐多，军机处职掌从军务扩大到了国家政务，不仅代皇帝拟旨、协助皇帝处理政务、掌管国家财政收支、各地督抚和各部院大臣的人事任免等涉及国家重大事务的交办工作都全部统管。

军机处主官为军机大臣，无官署无定员，都是从内阁大学士、各部尚书中由皇帝挑选出来兼任，最开始只有三个人，后来一般保持四到八人，最高峰时多达十一人。

军机大臣当中有一人作为领班军机大臣，称为首席军机大臣，军机大臣之下还设有军机章京。军机处很快就代替了南书房、内阁成为清代中央政府的核心中枢机构。

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