截至2014年5月，学校有科研机构91个，其中中央与地方高校共建基础实验室和特色实验室12个，自治区级重点实验室6个，自治区高校重点实验室2个，自治区高等学校重点实验室培育基地1个，自治区高等学校人文社会科学重点研究基地4个，自治区哲学社会科学研究基地1个，自治区工程技术研究中心1个，自治区工程实验室1个，自治区工程研究中心1个，自治区院士专家工作站1个。
自治区重点实验室（6个）：内蒙古自治区功能材料物理与化学重点实验室 、遥感与地理信息系统实验室、心理学重点实验室、生物多样性保护与可持续利用重点实验室、内蒙古自治区工业产品设计研究重点实验室、内蒙古自治区绿色催化重点实验室
自治区高校重点实验室（2个）：内蒙古自治区高校民族工业产品设计研究重点实验室、内蒙古资源与环境信息系统高校重点实验室
自治区高等学校重点实验室培育基地（1个）：生物多样性保护与可持续利用重点实验室
自治区高等学校人文社会科学重点研究基地（4个）：内蒙古师范大学思想政治教育理论与实践研究基地 、内蒙古自治区高校中国北疆史研究基地、内蒙古民族教育研究中心、内蒙古自治区高校心理教育研究中心
自治区哲学社会科学研究基地（1个）：内蒙古民俗文化研究基地
自治区工程技术研究中心（1个）：内蒙古自治区民族雕塑工程技术研究中心
自治区院士专家工作站（1个）：内蒙古师范大学绿色催化院士专家工作站 2006-2014年，学校共承担国家级课题200余项，省部级课题500余项，厅局级课题340余项，纵向课题1391项，横向课题180项，科研经费总额达到2.1亿元。出版学术专著600余部，发表学术论文6800余篇，被三大检索收录的论文360余篇。获省部级以上奖励320余项，申请专利30余项，获准授权18项。
2012年度国家自然基金项目 编号 项目名称 负责人 单位 经费（万元） 类别1 内蒙古草原牧区旱灾监测与风险评价、预警研究——以锡林郭勒盟为例 阿拉腾图娅 地理科学学院 48 地区科学基金 2 牧区城镇化的驱动力、模式及其生态效应模拟—以锡林郭勒典型牧区为例 佟宝全 地理科学学院 48 地区科学基金 3 季风边缘区湖泊沉积记录的全新世气候变化 春喜 地理科学学院 65 地区科学基金 4 中国北方草原区风力发电场对下垫面土壤性质的影响效应及机理研究 周瑞平 地理科学学院 50 地区科学基金 5 内蒙古呼包鄂地区工业化与生态环境变化的耦合机理及调控模式研究 甄江红 地理科学学院 48 地区科学基金 6 蒙古高原典型湖泊藻华光学特性与遥感监测技术研究——以乌梁素海为重点研究区 青松 地理科学学院 48 地区科学基金 7 相和尺寸控制合成稀土离子掺杂的复合氟化物纳米材料及其上转换发光性质研究 德格吉呼 化学与环境科学学院 50 地区科学基金 8 介孔二氧化钛/煤系高岭土-氧化铁复合材料的合成及其对水中污染物的吸附性能研究 长山 化学与环境科学学院 52 地区科学基金 9 锡林郭勒煤炭开发对草原景观格局和沙尘活动影响的监测与模拟研究 张宝林 化学与环境科学学院 50 地区科学基金 10 黄河内蒙古段沉积物-水界面间氮磷迁移转化与响应机制研究 王晓丽 化学与环境科学学院 48 地区科学基金 11 西方三角学在清代的流传与影响 董杰 科学技术史研究院 45 地区科学基金 12 中国传统力学知识体系的重构 仪德刚 科学技术史研究院 56 地区科学基金 13 现行蒙古文和标准音单词级对接标准码语料库建设 嘎日迪 蒙古学学院 20 面上项目 14 源于生活污水的再生水滴灌灌水器堵塞机理与堵塞风险评价 王勇 内蒙古节水农业工程研究中心 48 地区科学基金 15 蒙古高原冰云遥感反演及冰云对气候变化的影响研究 胡斯勒图 内蒙古自治区遥感与地理信息系统重点实验室 43 地区科学基金 16 内蒙古蒙古族饲用和兽药用植物传统知识的调查评价 哈斯巴根 生命科学与技术学院 5 地区科学基金 17 双生子儿童少年体格和心理发育的追踪研究 李玉玲 生命科学与技术学院 50 地区科学基金 18 我国蒙新区蜘蛛分类及区系研究 唐贵明 生命科学与技术学院 49 地区科学基金 19 非线性波理论中若干问题的符号计算研究 扎其劳 数学科学学院 45 地区科学基金 20 准晶非线性弹性与断裂力学及其相关问题研究 刘官厅 数学科学学院 52 地区科学基金 21 纤锌矿ZnO基量子阱中电子-声子相互作用和内建电场对电子态能级和结合能的影响 赵凤岐 物理与电子信息学院 51 地区科学基金 2012年度教育部人文社会科学研究项目 编号 项目名称 负责人 单位 经费 类别 1 内蒙古民族电影民族认同与国家认同建构整合研究 张芸 传媒学院 9万元 规划项目 2 内蒙古蒙古族大学生思想政治教育与校园和谐稳定研究 张大权 法政学院 1万元 专项项目 3 基层畜牧业技术推广制度安排、农技员推广行为与推广绩效研究以内蒙古锡林郭勒盟为例 张蕾 经济学院 7万元 青年项目 4 内蒙古草原旅游业发展视阈下草原文化的传承、保护与发展 葛宏 经济学院 9万元 规划项目 5 19—20世纪初期俄国合作社的思想和实践 袁丽丽 历史文化学院 7万元 青年项目 6 毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论 杨永利 马克思主义学院 10万元 专项项目 7 蒙古文历史小说与蒙古人的文化意识 哈申高娃 蒙古学学院 9万元 规划项目 8 双语文化背景下的呼和浩特市蒙古族语言生活研究 额勒森其其格 蒙古学学院 9万元 规划项目 9 关于蒙古历史经典文献的民俗学研究 双金 社会学民俗学学院 7万元 青年项目 10 近代化学译著中化学词语的演变研究 李丽 文学院 7万元 青年项目 11 高等师范院校对外汉语专业英语类课程建设与改革研究 胡素莲 文学院 7万元 青年项目 12 开展非常规物理实验对促进民族地区初中物理课程改革的实践研究 张伟 物理与电子信息学院 9万元 规划项目 学术期刊
内蒙古师范大学学术期刊社成立于2001年, 其前身是《内蒙古师范大学学报》编辑部。公开出版发行的期刊有以下6种：《内蒙古师范大学学报》哲学社会科学（蒙古文）版、《内蒙古师范大学学报》哲学社会科学（汉文）版、《内蒙古师范大学学报》自然科学（蒙古文）版、《内蒙古师范大学学报》自然科学(汉文）版、《内蒙古师范大学学报》教育科学版、《语文学刊》。
1997年，《内蒙古师范大学学报》编辑部被命名为全区首批“内蒙古新闻出版行业精神文明示范单位”。 2001年，《内蒙古师范大学学报》入选“中国期刊方阵·双效期刊”。2008年，自然科学（蒙、汉文）版编辑部被教育部科技司评选为“全国高校科技期刊先进集体”。
图书馆
截至2014年5月，图书馆藏图书204万余册，电子图书47万册，配备磁盘存储100TB。藏书中以蒙文图书和蒙古学图书资料丰富而独具特色，长期订阅中外文期刊（含电子期刊）近14000种。