朱元璋怕那些有功的大臣在自己死后造反，太子朱标驾奴不了这些开国功臣。所以他清洗杀戮很多立下汗马功劳的功臣，自明朝后很少有这种情况了。

朱元璋见太子朱标心肠比较软、性格懦弱，以后可能控制不了功臣。为了保住自己的江山，朱元璋部得不拿功臣们开刀，为儿子清除障碍。

开国功臣徐达是朱元璋儿时的伙伴，为大明的江山立下汗马功劳。朱元璋对他很不放心，徐达也知道朱元璋的想法，所以在他面前表现得非常的谦虚谨慎。朱元璋抓不到徐达的把柄，也不好随便杀他。有一次徐达背上生了毒疮，医生告诉他不能吃鹅肉。朱元璋知道后偏偏赏赐蒸鹅给他吃，徐达明白朱元璋的用意。他流着眼泪吃下了鹅肉，不久就毒性发作死了。

丞相胡惟庸野心很大，被朱元璋发现后杀掉了。胡惟庸在朝廷的势力很大，很多的大臣都与他有瓜葛。朱元璋下令追查胡惟庸的余党。当时朱元璋成立一个特务机构，叫锦衣卫，专门负责监视大臣们的活动。锦衣卫只听皇帝一个人的命令，其它的执法部门无权干涉。这次追查胡惟庸的同党，锦衣卫出了很大的力，凡是和胡惟庸稍有关系的人都被写上了名册交给朱元璋。最后共查出1.5万人，朱元璋下令全部杀掉。

朱元璋接着把前丞相李善长、他的儿女亲家傅友德、鄱阳湖决战的大功臣廖永忠都被赐死。几年后，大将蓝玉造反。朱元璋一口气杀了1万多人，明朝的开国功臣几乎一扫而光。

朱家的江山算是巩固下来了。但是朱元璋精心培养的朱标却过早的死了，真正造反的却是朱元璋最信任的四儿子燕王朱棣。