1、侧重点不同
学术型学位（学术理论研究）或专业型学位（注重操作实际能力）两种教育并轨，但一直以来，更偏重学术型学位教育，而少注重专业型学位教育，所以很多学术型学位研究生毕业后，只能大谈阔论，能理论能研究，但操作能力差。为了与世界上学位教育接轨，因此增加专业型研究生教育。
2、目的不同
专业学位与学术型学位处于同一层次，培养规格各有侧重，在培养目标上有明显差异。学术型学位按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构的研究人员；而专业学位以专业实践为导向，重视实践和应用，培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才。
3、学习方式不同
学术型硕士： 全日制学习。一般为3年。
专业硕士：脱产全日制学习，学制2-3年。
4、文凭颁发可能不同
学术型硕士同时颁发学位和学历证书。
专业硕士10月份单独考试颁发学位证书，1月份考试同时颁发学位和学历证书。



5、社会认可度不同
学术型硕士：由于是全日制正规大学硕士毕业，拥有学历、学位双证，因此社会对这样的毕业生的认可度非常高。但企业在招聘时也会考虑到全日制硕士研究生的弱点：光有理论，经验不足。特别对于硕士专业与本科专业方向完全不同，又从无相关工作经验的求职者，企业会有所顾忌。
专业型硕士：09年教育部新增的硕士研究生，毕业生已颇具规模，认可度已经受社会考验，且有国家颁发的“双证”，前景不错。
参考资料来源：百度百科-学术型硕士
参考资料来源：百度百科-专业型硕士