清代学术和宋明理学之间，存在一种互动关系，用两个字说：扬弃。
一是从清代学术总体趋向来看，学术主体已经转化为考据学，或称称汉学、朴学，理学已经衰落。但具体在清代各个时段，理学在清代的地位和影响仍不可忽视。康熙年间，程朱理学被定为官方统治思想，曾一度居于学术主导地位。清中叶，理学的学术地位逐渐边缘化，但是程朱理学所张扬的纲常伦纪，不仅为士人效法，而且在广大百姓中有着根深蒂固的影响。到晚清咸同年间，还一度出现理学“复兴”的局面，影响了学坛和政局。
二是有扬有弃。就清代理学的学术方面，对宋明理学既互相贬抑又兼采并蓄。清代把理学又称为宋学，以示与当下汉学的区分，《四库全书》归纳““要其归宿，则不过汉学、宋学两家,互为胜负”。但实际上，该时期在学理方面并无无创新，仍重在道德规范。这一时期，对汉学和理学不乏客观认识，认为汉学虽有自己的根柢，但并没有把学理讲透，“不足服汉儒”；而认为宋学虽精微，但比较“空疏”不被学者重看。所以，主张“消门户之见,而各取所长”,这种指导思想也体现在汉对理学兼容并蓄的行为上。

第二次鸦片战争后,清朝统治者集团面对的主要问题是

主要问题是如何解决内忧外患
第二次鸦片战争发生在1856年至1860间。在第二次鸦片战争前，中国大地已经爆发了太平天国运动，清政府极力镇压它。第二次鸦片战争发生后，清政府依然将主要精力用在镇压太平天国运动上，面对英法的侵略寄希望美俄调停，“息兵为要”的方针。在与外国人打交道过程中，清政府认识到洋人并不是要她的权力，逐渐与洋人勾结共同对付太平军。总之，清政府对内采取镇压-安抚-镇压的态度；对外采取妥协退让，寄希望调停，跟洋人示好以维护统治地位