先后主编出版《企业联合中的若干法律问题研究》、《经济法》、《中国证券法学》、《公司法》、《公司的设立和运作》、《新兴市场中的法律问题研究》、《金融市场运行与法律监管》、《公司法律评论》、《经济法教程》、《商法教程》等多部著作，发表《国有企业深化改革的法制方略》、《市场经济与我国商法和经济法的发展》等论文近百篇，完成《辞海》（1999年新版）有关经济法全部条目编写，主持上海市教委重点学科项目建设。主持或参与各类科研重点课题15项，参与立法起草或讨论20余项。顾功耘教授提出经济法理论新构架，重新界定经济法的调整对象和范围，受到学术界关注。他先后赴美国、新加坡、爱尔兰、日本等国进行学术交流和演讲。2001年，荣获上海市劳动模范、上海市职工职业道德十佳标兵称号，2002年，荣获全国五一劳动奖章，2004年荣获上海市优秀人才称号。