答案为：占50%，

设甲校获奖人数为6x，则乙校为5x，设甲校获二等奖的人数为5y，则乙校为6y

（ 5y+6y）÷（5x+6x）=60%

得到：y=3/5×x

5y÷（6x）=3x÷（6x）=50%

所以正确的答案为：50%